Насколько я понял, в итоге магазин получается на CMS OpenCart. Сама CMS эта мне нравится, сталкивался с ней раза 4 где-то (от разработки шаблона до написания своих модулей).
Я бы конечно делал магазин без appee. Но если заказчица сильно хочет -- можно наверное и на appee попробовать.
Единственное, что нужно будет узнать -- насколько этот сервис дружелюбен к изменению функционала.
Например, в моём случае была задача реализовать такую фичу: администратор загружает в систему CSV-файлик и система проставляет всем товарам в магазине новые цены из этого файлика (а товары, которых в файлике нет -- выключает).
Еще были задачи добавить несколько текстовых полей к товарам (для SEO целей)...
Сам OpenCart спроектирован достаточно грамотно и подобные изменения не составят труда. Но разрешит ли это делать appee?
В общем, все как всегда: постарайтесь заглянуть в будущее и спрогнозировать все возможные фичи, которые понадобятся вам в вашем магазине. Ну и узнайте у appee возможно ли их будет реализовать.